ケイヒやキンタイと連携している申請書もフォローできますか？

はい。ケイヒやキンタイと連携している申請書も、申請書のフォロー機能を利用できます。

申請書のフォロー操作は、ワークフローのユーザー画面から行います。
ワークフローにアクセスし、フォローしたい申請書の詳細画面を開いて、「この申請をフォロー」をクリックしてください。